Nasceu em Aracaty a 21 de Dezembro de 1788, sendo seus paes o Sargento-mór Bento Francisco da Silva e D.a Theresa de Jesus Maria e foi baptisado pelo Padre Francisco Xavier a 1 de Janeiro de 1789, sendo padrinho o Mestre de Campo Pedro José da Costa Barros.
Neto paterno de Manoel Francisco e D.a Thereza da Sjlva, naturaes dos arredores de Coimbra, e materno de Francisco José da Fonseca, natural de S. Martinho de Travassos, Arcebispado de Braga, e de D.a Francisca Xavier, natural de S. Antonio do Recife, Pernambuco.
Viveu e morreu solteiro no Rio de Janeiro. Teve três irmãos, que foram padres.
Era tio do Major Julio Cesar da Fonseca (vide) e do Padre Thomé Pompilio da Fonseca, ordenado em Maranhão e fallecido de tuberculose pulmonar.
Thomé Maria da Fonseca foi um dos fundadores do Instituto Histórico e Geographico Brazileiro e quando a 25 de Novembro de 1838 procedeu-se á eleição das Commissões dirigentes elle e Alexandre Maria de Matiz Sarmento constituíram a commissão de fundos da novel associação.
Sobre esse distincto patrício disse Araujo Porto Alegre na sessão publica anniversaria celebrada a 15 de Dezembro de 1852:
O Instituto deve grandes serviços ao seu honrado membro Thomé Alaria da Fonseca Silva, que occupou o logar de thesoureiro por muitos annos, e- nos deixou na Revista um documento do seu amor pela prosperidade nacional. Sérvio o logar de inspector da recebedoria, foi um membro zeloso em todas as sociedades a que pertencia, e tinha sentimentos patrióticos, que o constituíam um verdadeiro Brazileiro; a colonisação foi o seu sonho de amor, e o trafico da carne humana o seu constante pesadelo”.
Thomé Maria escreveu1
- Breve Noticia sobre a colônia de Saissos fundada em Nova Friburgo.
Ha delle um trabalho citado por Macedo Soares (sobre as Camaras Municipaes) e referente á Colonisação Alieni ã no Brasil.