Filho do negociante Boaventura da Costa Aguiar e de D.a Joanna Virgínia de Paula Aguiar, fallecida em Belém com 65 annos de edade a 4 de Agosto de 1885, nasceu em Sobral a 9 de Agosto de 1847.
Discípulo do Padre M.e Antonio da Silva Fialho e de Vicente Ferreira de Arruda, deixou os cursos desses seus mestres e amigos para vir á Capital da Província afim de matricular-se no Seminário Diocesano (1866), onde recebeu as ordens de presbytero a 30 de Novembro de 1870.
Cantou a primeira missa na (erra do berço a 8 de Dezembro.
Por provisão do bispo Dom Luiz Antonio dos Santos, de 9 de Novembro de, 1872, foi nomeado cura de Fortaleza, cargo que occupou até 1875 e deixou para mudar-se para o Pará a convite do respectivo Diocesano, o immortal Macedo Costa, que o fez Conego de sua Cathedral, vigário geral do Amazonas, cura da Sé de Belém e secretario do bispado. Foi ainda vigário geral interino do bispado do Pará e por vezes seu governador na ausência de Dom Antonio.
Eleito em vários biennios deputado á Assembléa pelo l.o districto de Belém, José Lourenço foi também provedor da Santa Casa de Misericórdia de Belém, do Asylo de Alienados, do Hospício dos Lázaros de Tucunduba.
Homem da imprensa, foi proprietário e redactor chefe da Tribuna Catholica, de Fortaleza, e redactor da Bôa Nova, Constituição e Diário do Oram-Pará.
Desgostoso da politica, dissolvida a Camara dos Deputados Qeraes. de. .que fazia parte como representante do Pará por motivo da proclamação da Republica, o Conego José Lourenço partiu para Roma e ahi entregou-se aos estudos no Collegio dos Nobres para-obtenção do grau de doutor em direito civil e canonico com que foi laureado pela Universidade de Santo Apolinário.
Ao mesmo tempo o Summo Pontífice galardoava-o com a dignidade de Monsenhor camareiro secreto.
Tendo regressado ao Brasil, foi em Junho de 1893 nomeado bispo do Amazonas. Sua sagração effectuou-se a 11 de Março do anno seguinte na Egreja do Sagrado Coração de Jesus de Petrópolis, sendo sagrante Dom Frei Jeronymo Maria Gotti, o internuncio Apostólico de então, e assistentes o bispo de Nictheroi Dom Francisco do Rego Maia e o então bispo de Argos Dom Joaquim Arco Verde, (Ilustre Arcebispo do Rio de Janeiro, a quem o Summo Pontífice Pio X se dignou elevar ao cardinalato, assignalando dessa sorte a preeminência do Brasil na hierarchia da America Meridional.
Tomou posse do bispado e inaugurou a Diocese a 1 8 de Junho de 1894.
Era emblema de suas armas de 1.o bispo do Amazonas, montanha de alto porte batida no sopé pelas aguas de rio caudaloso e no alto um condor a voar.
Falleceu em Lisboa a 5 de Junho de 1905 victimado por congestão cerebral em consequência de diabetes. Era hospede da Condessa de Redinha de cuja casa foi transferido para o hospital de S. José. Assistiram-lhe os últimos momentos o Arcebispo de Mytilene e o Cardeal Patriarcha de Lisboa, que lhe ministrou os Sacramentos.
Fazia parte do Instituto Histórico e Geographico Brasileiro e do Instituto Histórico e Geographico de S. Paulo.
Do bispo Dom José Lourenço conheço4
- Discursos pronunciados nas sessões de 11 de Agosto e 9 de Setembro de 1887 da Camara dos Deputados, folheto de 60 pp. impresso na Imprensa Nacional, Rio de Janeiro, 1887.
- Carta Pastoral, Despedida para a 1.a Visita ad Limina Apostolorum, Manaus, Typ. d'A Federação, rua Joaquim Sarmento, 1896.
- Christa Muhençaua Curimaan uara Arama. Nhihingatu Tupi Doutrina Christã destinada aos naturaes do Amazonas em Nhihingatu, Petrópolis, Pap. e Typ. Pacheco, Silva & C.a 1898, in 8.o de 87 pp.
- Discurso proferido nas exéquias celebradas na Cathedral do Amazonas por alma do immortal Pontífice Leão XIII.